糞便能夠有效反應出奶牛腸胃的消化狀況，許多生產者都能明白，糞便變稀有可能是由于日糧粗蛋白含量過高引起，但是不能意識到糞便與瘤胃健康狀況有關，糞便異常，即使產奶正常，也表明奶牛有一定的健康問題。通過調整日糧來改善奶牛糞便狀況，不僅可以有效提高產奶量，更重要的是能有效提高飼料的利用效率。
理想糞便的狀態
健康奶牛的糞便看起來應該象擠成一團的奶油，有些人稱為麥片粥狀，應該有3~6圈，高度大約3.8厘米，中間有個小窩，可看到的谷物顆粒和纖維（16px）應該很少。
瘤胃可降解蛋白對糞便的影響
通常當給奶牛更換高蛋白飼草并且日糧營養不平衡時，由于含有太多的可消化蛋白，奶牛的糞便會變稀，一般出現這種情況，全群奶牛的糞便都會變的較稀。
瘤胃酸中毒對糞便的影響
糞便出現變稀、糊狀、部分發亮、含有氣泡，這有可能是酸中毒的征兆。牛群出現酸中毒，部分牛會有較硬的糞便，部分牛糞便正常，而部分牛會有較為典型的酸中毒特征。這種差異也正是區別糞便變稀是由酸中毒還是由過量瘤胃降解蛋白引起。酸中毒發生后糞便出現表觀差異，主要是因為出現酸中毒后有些牛繼續采食精料，而有些牛卻拒食精料。例如，一頭牛在星期一還表現良好、采食、糞便正常，但在星期四就有可能發生瘤胃酸中毒，出現較稀、糊狀的糞便，接下來幾天她的采食量降低，喜食飼草，在星期六糞便變硬。這種糞便的變異性還有可能是由于奶牛挑食引起，有些時候采食過量精料，有些時候采食過多飼草。挑食可以導致酸中毒。糞便中可以看到飼草纖維同樣是酸中毒的征兆。當日糧中長、有效纖維數量不足，瘤胃內環境就會變的異常，瘤胃內環境發生異常，纖維分解菌的消化、繁殖性能就會受到抑制，纖維不能完全消化隨糞便排出。
發生酸中毒奶牛的糞便為何會含氣泡？
當酸中毒發生，瘤胃中就會積累大量的酸，由于酸性環境會抑制纖維分解菌的功能，纖維在瘤胃的消化率就會下降。酸中毒主要是由于長的有效纖維采食不足，一旦發生，瘤胃內環境就會被破壞，就會使纖維及谷物通過瘤胃的速度加快，大量谷物及飼草未經完全消化就直接進入大腸，在大腸中被發酵，氣體就在發酵過程中產生，在糞便排出之前微生物發酵及氣體產生的過程一直都在進行，因此會在糞便中看到氣泡，這個過程對飼料同樣也是一個很大的浪費。
酸中毒奶牛的糞便為什么會有光澤？
大量的酸進入大腸或在大腸中產生就會損害大腸的內壁，大腸為了抵御這種損害就會分泌黏液進行保護，糞便排出時黏液就會覆蓋在糞便表面產生光澤。
糞便為什么會變稀？
當酸中毒發生，部分乳酸通過瘤胃進入大腸，同時精料進入大腸繼續發酵產生大量的酸。大腸為了抵御這些酸所產生的滲透壓，就會從血液吸收水分進入腸道，這樣就會增加糞便中的水分含量，使糞便變的較稀。當日糧中粗蛋白或礦物質含量較高，這些物質進入大腸后同樣也會產生很高的滲透壓，使血液的水分進入大腸，從而使糞便變稀。
糞便中為什么能看到谷物？
谷物的胃流速度如果太快、消化不完全就有可能在糞便中看到，這主要由兩個原因引起，首先、瘤胃內環境較差時會增加胃流速度，這種情況可以通過增加日糧有效纖維的用量或同時增加有效纖維的長度來調理。第二、瘤胃微生物消化谷物的能力不足。日糧缺乏可降解蛋白或一些特殊的可溶解蛋白，影響瘤胃微生物的功能。另外有些淀粉有降低動物消化力的天然特性，飼喂前必須經過一定的處理，粉碎或熟化可以有效提高瘤胃微生物的消化速度。日糧中含太多的瘤胃慢速降解淀粉，會導致糞便中出現可見谷物，瘤胃微生物需要合理比例的快速降解纖維、糖及慢速降解纖維，通常可以通過用快速降解纖維及糖來代替慢速降解纖維來減少糞便中的可見谷物。日糧添加2-4%的糖及3-6%的快速降解淀粉可以有效改變糞便的狀態。
總的來說，谷物在瘤胃中降解率越高在糞便中出現的就越少，瘤胃中產生的酸也就越多，因此充足的有效纖維是非常必要的，要避免因谷物飼喂太多而引起酸中毒。精料在瘤胃消化的越多越完全就越能為產奶提供更多的能量和蛋白。